San Francisco : infection par le virus de la grippe aviaire hautement pathogène A(H5N1) chez un enfant sans exposition connue
Description du cas
Un enfant d'âge scolaire de San Francisco a présenté le 13 décembre 2024 un tableau clinique associant fièvre, douleurs abdominales, myalgies et conjonctivite. Le 16 décembre, il a consulté aux urgence où des tests de dépistage de la grippe, du virus respiratoire syncytial et du COVID 19 ont été effectués sur un échantillon nasopharyngé. La rRT-PCR était positive pour la grippe A. Dans le cadre de la surveillance renforcée mise en place par le Département de la Santé publique de San Francisco face ) l'épidémie de grippe aviaire hautement pathogène (IAHP) A(H5N1) chez des vaches laitières américaines, l'échantillon a ensuite été au SFDPH PHL pour des analyses complémentaires. Le 9 janvier 2025, l'échantillon initial s'est révélé positif à la grippe A(H5), résultat confirmé par les CDC le 14 janvier. Un deuxième échantillon (oropharyngé), prélevé le 10 janvier (25 jours après le premier, alors que l'enfant était asymptomatique depuis 21 jours), s'est révélé positif à la grippe A(H5) ; les échantillons prélevés quatre jours plus tard se sont révélés négatifs. Le séquençage a révélé la présence de virus du clade 2.3.4.4b, de génotype B3.13, étroitement apparentés aux virus B3.13 détectés chez l'homme et l'animal en Californie. Les analyses phylogénétiques ont révélé que les séquences se regroupaient sur une branche indépendante par rapport aux autres séquences humaines et bovines laitières californiennes. Des modifications de nucléotides et d'acides aminés dans les gènes de l'hémagglutinine (HA) et de la nucléoprotéine (NP) ont été observées entre les deux séquences, ce qui est cohérent avec la réplication virale. Aucun marqueur critique d'adaptation aux mammifères n'a été identifié.
Enquête sur le cas index
Le patient index vivait en milieu urbain, ne voyageait pas et n'avait signalé aucun contact avec des vaches laitières, des chats, des volailles, des oiseaux ou d'autres animaux sauvages au cours des 10 jours précédant l'apparition de la maladie ; la famille possédait un chien. Il n'y avait pas d'animaux à l'école et la famille du patient n'exerçait pas de professions augmentant le risque d'infection par le virus A(H5N1) (manipulation, abattage, plumage, découpe, abattage, soins ou traite d'animaux infectés). Un membre de la famille du patient avait acheté de la volaille crue sur un marché aux oiseaux vivants deux semaines avant l'apparition de la maladie, mais l'enfant n'a pas été exposé à la viande et la volaille avait été cuite et consommée le jour même de son achat soir 15 jours avant l'apparition des signes. De plus l'enfant n'était pas allé au marché et un test A(H5) effectué sur le marché était négatif. Bien qu'aucune exposition à des oiseaux sauvages n'ait été signalée, l'enfant a passé du temps à l'extérieur, à l'école ; une exposition environnementale ne pouvant donc pas être formellement écartée. San Francisco, est située sur une route migratoire des oiseaux et, en 2024, le virus A(H5) a été détecté dans un marché d'oiseaux vivants, des oiseaux sauvages et des eaux usées.
Enquête sur les contacts étroits
Parmi les 84 personnes identifiées comme contacts possibles du patient index (sept membres du foyer, 53 membres de l'école et 24 membres du personnel soignant), 67 (80 %) correspondaient à la définition de contact étroit.
- Aucun contact familial n'a signalé de maladie. Sept prélèvements réalisés chez les contacts proches étaient A(H5) négatif.
- Des absences scolaires ont été signalées pour 34 (64,2 %) contacts scolaires, dont 26 (76,5 %) ont été interrogés (un enseignant et les parents de 25 enfants). Tous les parents interrogés ont signalé des maladies respiratoires chez leurs enfants, dont sept étaient symptomatiques au moment de l'entretien. L'enseignant avait présenté des symptômes compatibles avec la grippe, mais était asymptomatique au moment de l'entretien. Quatre personnes ont été testées pour un ou plusieurs virus respiratoires (COVID-19, VRS ou grippe) alors qu'elles étaient malades ; tous les résultats des tests pour la grippe étaient négatifs.
- Parmi les 24 professionnels de santé contacts, 11 (45,8 %) ont répondu à un questionnaire, dont sept qui avaient été en contact étroit avec le patient ; aucun cas n'a signalé de symptômes compatibles avec la grippe.
Des échantillons de sérum ont été prélevés chez le patient index 32 jours après le début de la maladie, chez trois contacts familiaux adultes, deux contacts scolaires et quatre professionnels de santé contacts. Parmi ces neuf contacts, l'intervalle médian entre leur première exposition au patient index et le prélèvement du sérum était de 45 jours, et l'intervalle médian entre leur dernière exposition et le prélèvement du sérum était de 26 jours. Le patient présentait des anticorps contre les trois virus A(H5N1) de type sauvage testés, avec des titres d'anticorps élevés dans tous les tests, compatibles avec une infection récente par le virus H5N1. Les résultats sérologiques des neuf contacts proches étaient négatifs pour ces trois virus.
L'absence de preuves biologiques (moléculaires et sérologiques) d'une infection actuelle ou récente par le virus A(H5N1) parmi les contacts proches suggère l'absence de transmission interhumaine.