Que dire du variant EG.5 de la covid 19 ?
La covid 19 fait reparler d'elle cet été dans la presse du fait de l’émergence du variant EG.5 baptisé par certains Eris.
EG.5 est un sous-lignage de XBB.1.9.2 qui a été signalé pour la première fois le 17 février 2023. Il a été classé par l’OMS comme variant sous surveillance (VUM) le 19 juillet 2023, puis comme un variant d'intérêt (VOI) le 9 août 2023. (Pour plus d’information sur les variants en circulation actuellement voir ici).
EG.5 porte une mutation supplémentaire dans la protéine spike (ou protéine de pointe) par rapport à la sous-variante parentale XBB.1.9.2, et la sous-variante EG.5.1 présente une mutation supplémentaire par rapport à EG.5.
Au 7 août 2023, 7 354 séquences d'EG.5 ont été soumises à la GISAID par 51 pays. La plus grande partie des séquences d'EG.5 provient d’ Asie (55,8%) [Chine (30,6 %), République de Corée (14,1 %), Japon (11,1 %)] et d’Amérique du Nord (23,7%) [États-Unis d'Amérique (18,4 %), Canada (5,3 %)], l’Europe représentant 6,7% [Royaume-Uni (2,0 %), France (1,6 %), Portugal (1,6 %), Espagne (1,5 %)]. Près de 90% des séquences mondiales de EG.5 correspondent à son sous-lignage EG.5.1.
À l'échelle mondiale, la proportion de cas d'EG.5 signalés a augmenté régulièrement avec une prévalence de 17,4% la semaine 29, contre 11%, 10% et 7,6% respectivement les semaines 27, 26 et 25. Par rapport à de précédents variants, l'augmentation de EG.5 suit une dynamique plutôt lente. De plus, EG.5 semble se stabiliser autour de 45 % des variants en Chine et entre 15 et 20 % au Japon et en Corée du Sud. Ces éléments sont en faveur d'un avantage de croissance relativement faible de EG.5 par rapport aux autres variants circulant actuellement. En France métropolitaine, on observe une augmentation de la détection de EG.5.1 : il représentait 26 % des séquences interprétables de l’enquête Flash du 17/07/2023 contre 15 % au cours de l’enquête Flash du 10/07, ce qui est cohérent avec la situation mondiale.
En terme de gravité de la maladie , il n’y a pas eu de changement signalé depuis l’émergence du variant EG.5, les infections par le variant EG.5.
Il a été montré in vitro avec l’utilisation de pseudovirus de type XBB.1.5 présentant également la mutation de la protéine spike décrite chez EG.5 une diminution, voire un échappement à la neutralisation par les anticorps neutralisant XBB.1.5. EG.5 reste cependant proche des autres XBB.1.9 et, des données publiées en pré-print (publication issue d’un seul laboratoire et non relue par des pairs) sont en faveur d’une protection croisée avec les autres sous-lignages de XBB. Cet avantage de croissance et sa capacité d’ échappement immunitaire participent à l’augmentation de l'incidence des cas et EG.5 pourrait devenir dominant dans certains pays, voire dans le monde entier.
Rappelons que la vaccination contre la covid 19, notamment pour les personnes à risque, reste importante et la campagne de vaccination grippe et covid 19 prévue cet automne fera l’objet d’une prochaine communication.
Sources : Santé Publique France, Organisation Mondiale de la Santé.