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Le point sur la circulation des virus grippaux en Europe

Publié le 14 nov. 2020 à 22h10

Auteur : Jacques MORVAN

Biographie

- Médecin biologiste à la retraite.
- Auparavant : médecin biologiste dans un hôpital d'Instruction des armées pendant 6 ans, puis détaché pendant 20 ans par le Service de santé des armées comme virologiste d'abord puis comme directeur dans 3 instituts du Réseau international des Instituts Pasteur.

Liens d'intérêt

- Aucune rémunération actuelle ou dans le passé de l'industrie pharmaceutique.
- Aucun investissement financier dans une firme pharmaceutique.
- Aucune participation à des études cliniques de vaccins.

À la semaine 44/2020, seules 39 détections de grippe dans la Région européenne de l'Organisation Mondiale de la Santé avaient été signalées au Système européen de surveillance (TESSy). Dans 59 % des cas un virus de type A est en cause, le virus A(H3N2) prévalant sur A(H1N1)pdm09, et dans 41 % des cas il s'agit d'un virus de type B, aucun n'ayant été attribué à une lignée.

Cela constitue une baisse de 97 % des détections par rapport à la même période en 2019, probablement en raison de la pandémie COVID-19 et des mesures mises en place pour la combattre.

Depuis le rapport de caractérisation de septembre 2020, aucune expédition d'échantillons positifs pour la grippe en provenance des pays de l'Union européenne/EEE ou d'ailleurs n'a été reçue au Centre collaborateur de l'OMS à Londres, le Francis Crick Worldwide Influenza Centre (WIC). 

Le rapport d'octobre se concentre principalement sur la caractérisation génétique des virus de la grippe collectés avant la semaine 40. Aucun virus détecté au cours de la saison 2020-2021 (semaines 40-44/2020) n'a été génétiquement caractérisé. Pour la saison 2019-20, 2 752 virus ont été caractérisés génétiquement et attribués à un clade génétique jusqu'à la semaine 20/2020 (aucune caractérisation supplémentaire n'a été signalée au cours des semaines 21-39/2020).

  • La grande majorité des virus A(H1N1)pdm09 ont continué à appartenir au sous-clade génétique 6B.1A5.
  • Les virus A(H3N2) circulant récemment ont continué à appartenir aux clades 3C.2a et 3C.3a, la grande majorité des virus de clade 3C.2a appartenant au groupe 3C.2a1b.
  • Sur les quatre groupes de virus antigéniquement distincts de la lignée B/Victoria, seuls deux ont circulé récemment, un petit nombre de ceux du sous-clade 1A(2) avec une délétion de deux acides aminés dans HA1 et de ceux désignés comme sous-clade 1A(3)B avec une délétion de trois acides aminés dans HA1 qui étaient extrêmement dominants.

Source : European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC).

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