France : l'activité de la grippe augmente ; possible moindre efficacité vaccinale vis à vis du virus A(H3N2) ; importante circulation du SARS-CoV-2 ; poursuite de l'épidémie de bronchiolite

En France, en semaine 52, les indicateurs des infections respiratoires aigües sont en augmentation en médecine de ville et à l'hôpital.

1. Grippe saisonnière

Les indicateurs de la grippe/syndrome grippal étaient en forte augmentation traduisant une intensification de la circulation des virus grippaux dans l’Hexagone. Cette augmentation concernait toutes les classes d’âge et était plus particulièrement marquée à l’hôpital notamment chez les 0-14 ans et les 65 ans et plus.

Dans l'Hexagone, l’épidémie continuait de progresser avec cette semaine le passage des régions Centre-Val de Loire, Nouvelle-Aquitaine et Corse en épidémie. Dix régions au total étaient en épidémie (Auvergne-Rhône-Alpes, Provence-Alpes-Côte d'Azur, Occitanie, Bourgogne-Franche-Comté, Grand Est, Île-de-France, Hauts-de-France, Centre-Val de Loire, Nouvelle-Aquitaine et Corse) et trois en phase pré-épidémique (Pays de Loire, Bretagne, Normandie).

Les données virologiques étaient en nette augmentation en médecine de ville et à l'hôpital. En médecine de ville, le taux de positivité était en augmentation en S52 (19,% soit +2,3 point vs S51) et à l'hôpital (10,7% soit +4 points vs S51).

Depuis la S40, 94 cas graves de grippe ont été signalés, dont 67% avaient plus de 18 ans. Pour les 76 cas pour lesquels le virus a été typé, 74 virus de type A ont été identifiés, dont 23 virus de type A(H3N2). Parmi les 64 cas pour lesquels le statut vaccinal était renseigné, 56 n’étaient pas vaccinés contre la grippe. Sept décès ont été signalés, dont 4 chez les 65 ans ou plus (données non consolidées).

En ville, parmi les 2 044 prélèvements testés depuis la semaine 40, 111 virus grippaux ont été détectés, la très grande majorité étaient de type A : 70 A(H1N1)pdm09, 31 A(H3N2), 9 A non sous-typés, et 1 B/Victoria. A l'hôpital, parmi les 141 767 prélèvements testés depuis la semaine 40, 3 642 se sont avérés positifs pour un virus grippal (2,6%), dont 3 096 virus de type A non sous-typés, 273 A(H1N1)pdm09, 106 A(H3N2) et 167 virus de type B.

Les analyses de caractérisations antigénique et génétique réalisées par le CNR des virus respiratoires sur les virus grippaux A(H3N2) et A(H1N1)pdm09 co-circulant ces dernières semaines indiquent que :

• les virus A(H1N1)pdm09 caractérisés sont antigéniquement apparentés à la souche vaccinale présente dans le vaccin hémisphère nord 2023-24 (A/Victoria/4897/2022 clade 5a.2a.1). Le séquençage montre que les virus circulants appartiennent aux clades 5a.2a ou 5a.2a.1. Actuellement les virus A(H1N1)pdm09 sont majoritaires et **le profil antigénique des virus permet d’anticiper une bonne efficacité du vaccin## . - les virus

A(H3N2)** caractérisés présentent un profil antigénique non totalement apparenté à la souche vaccinale présente dans le vaccin hémisphère nord 2023-24 (A/Darwin/9/2021 clade 2a). Ils sont antigéniquement apparentés aux souches du clade 2a.3a.1 présent dans le vaccin hémisphère sud 2024 (A/Thaïland/8/2022 et A/Massachusetts/18/2022). Le séquençage montre que les virus circulants appartiennent aux clades 2a.3a ou 2a.3a.1, ce dernier clade étant actuellement majoritaire parmi les H3N2. Pour les virus A(H3N2), la protection vaccinale pourrait être plus faible.

Dans les DROM, la Guyane et Mayotte étaient en épidémie et la Guadeloupe passait en épidémie cette semaine. La Martinique est toujours à un niveau de base. A La Réunion, les indicateurs sont revenus à leur niveau de base.

Rappelons que la campagne de vaccination contre la grippe a débuté le 17 octobre 2023 dans l'Hexagone.

2. Bronchiolite

Le pic de l'épidémie de bronchiolite a été atteint en semaine 48 dans l'Hexagone. En semaine 52, l'épidémie de bronchiolite se poursuivait en France hexagonale et en Corse, excepté en Bretagne qui est passée en phase post-épidémique. L'ensemble des DROM, à l'exception de la Réunion, est toujours en phase épidémique.

En semaine 52, les indicateurs syndromiques étaient en diminution pour la quatrième semaine consécutive tout en restant à un niveau élevé dans toutes les régions hexagonales. Chez les moins de 2 ans, la bronchiolite représente respectivement 7,1% ( -0,2 points vs S51), 15 % ( -2,7 points) et 33,2 % ( -2,3 points) des actes de SOS médecins, des passages aux urgences et des hospitalisations après passage aux urgences.

Le taux de positivité pour le VRS dans les prélèvements naso-pharyngés tous âges était baisse en ville (3,6 % soit -5,6 points vs S51) et en milieu hospitalier (9,4 % soit -1,4 points). D’autres virus susceptibles d’induire des bronchiolites continuent de circuler.

3. Covid 19

Concernant le covid, les indicateurs syndromiques se stabilisaient ou continuaient de baisser en ville et à l'hôpital mais restaient à des niveaux élevés. Cette diminution en période de vacances scolaires était observée dans toutes les classes d'âge en ville et à l’hôpital, excepté chez les 0-4 ans pour lesquels une légère augmentation des hospitalisations était observée.

Depuis la S40, # 369 cas graves de covid

ont été signalés, dont 92% étaient âgés de plus de 18 ans. Parmi eux, la majorité étaient des hommes et la présence de comorbidité était reportée pour 89% des cas. Soixante-et-un décès ont été signalés, dont 50 chez les 65 ans et plus (données non consolidées). Sur les 188 cas pour lesquels les informations concernant la vaccination étaient connues, seuls 2 avaient bénéficié d'un rappel datant de moins de 6 mois.

Le taux de positivité des prélèvements étaient en diminution en médecine de ville (19,6% soit -2,8 points vs S51) et à l'hôpital (16,6% soit -2,5%) . Le taux de positivité des tests en laboratoires de biologie médicale était de 19,4% (-5,6 points vs S51). Dans les eaux usées, le taux de détection du SARS-CoV-2 restait à un niveau élevé avec une tendance globale à la stabilisation voire une baisse sur certains sites.

Concernant la surveillance génomique, la dynamique d' augmentation du variant BA.2.86 , qui est aujourd'hui le majoritaire en France hexagonale, se poursuit : il représentait (ses sous-lignages inclus) 77% des séquences interprétables de l’enquête Flash du 11/12/2023 (contre 71% pour celle du 04/12). Cette augmentation est portée principalement par JN.1, sous-lignages de BA.2.86, qui représentait 66% des séquences interprétables de l’enquête Flash du 11/12/2023, contre 63% pour la précédente. Le variant EG.5 représente encore 13% des séquences interprétables de l’enquête Flash du 11/12/2023.

A l’issue de la semaine 52, la couverture vaccinale covid de la campagne d’automne 2023 pour les personnes âgées de 65 ans n'a pas progressé. Elle est de de 28,7% (+0,2% sv S41) [21% des 65-69 ans (+0,2), 26,4% (+0,2) des 70-74 ans, 34,2% des 75-79 ans (+0,3) et 34,2% (+0,3) des 80 ans et plus]. Depuis le 17 octobre 2023, 30,2 % des vaccinations contre la covid chez les personnes âgées de 65 ans et plus ont été réalisées en même temps qu’un vaccin contre la grippe.

Dans ce contexte de circulation élevée des différents virus respiratoires et en complément de la vaccination contre la grippe et la COVID-19, l’adoption systématique des gestes barrières par tous reste primordiale notamment le port du masque en cas de symptômes, dans les lieux fréquentés et en présence de personnes fragiles. Ces mesures sont un moyen efficace pour se prémunir des infections respiratoires et de leurs complications en limitant le risque de transmission de ces virus à l’entourage, notamment les personnes à risque

Source : Santé publique France.