Le point sur les nouveaux foyers de grippe aviaire hautement pathogène identifiés dans des élevages de volailles depuis le 16 janvier : 11 pays touchés Médecine des voyages

Publié le 25 jan. 2021 à 23h45

Biographie

- Médecin biologiste à la retraite.
- Auparavant : médecin biologiste dans un hôpital d'Instruction des armées pendant 6 ans, puis détaché pendant 20 ans par le Service de santé des armées comme virologiste d'abord puis comme directeur dans 3 instituts du Réseau international des Instituts Pasteur.

Liens d'intérêt

- Aucune rémunération actuelle ou dans le passé de l'industrie pharmaceutique.
- Aucun investissement financier dans une firme pharmaceutique.
- Aucune participation à des études cliniques de vaccins.

Ce bilan fait le point au 24 janvier 2021 sur les nouveaux foyers de grippe aviaire hautement pathogènes (GAHP) à virus A(H5) signalés dans les élevages depuis le bilan publié le 16 janvier 2021 (nouvelle 16914). Ce bilan repose essentiellement sur les signalements faits à l'Organisation mondiale de la santé animale (OIE).

Ces dernières semaines 11 pays ont rapporté l'existence de foyers de GAHP à virus A(H5). Trois virus A(H5) sont impliqués dans les foyers d'influenza aviaire décrits dans cette nouvelle :  le virus A(H5N8) en Allemagne, en France, en Inde, en Irak, au Koweït, en Pologne, en République de Corée, en Russie, en Suède et en Ukraine ; le virus A(H5N1) en Inde et au Viêt Nam, et le virus A(H5N5) en Suède.

1. Allemagne

En Allemagne, l'épisode de GAHP à virus A(H5N8) qui avait débuté le 16 novembre 2020 en Basse-Saxe (voir les nouvelles 16690, 16882  et 16914) se poursuit. Les autorités sanitaires allemandes ont signalé à l'OIE les 18 et 22 janvier 2021 (signalements OIE 37692 et 37817) la survenue de 5 foyers supplémentaires ce qui porte à 27 le nombre de foyers constituant cette épisode.

Sur ces 5 nouveaux foyers, 2 ont été mis en évidence dans l'arrondissement de Cloppenburg :

  • Un foyer a été identifié à Lastrup le 15 janvier 2021 dans un élevage de 7 458 dindes (3 244 étaient malades dont 8 étaient mortes)
  • Un second foyer a été identifié le même jour à Emstek dans un élevage de 7 449 dindes (2 487 étaient malades dont 4 étaient mortes)

Un foyer a été identifié à Wurster Nordseeküste dans l'arrondissement de Cuxhaven le 17 janvier 2021. Il concernait un élevage de 15 800 dindes dont 4 étaient mortes.

Un foyer a été identifié le 20 janvier 2021 à Ganderkesee dans l'arrondissement d'Oldenburg dans un élevage de 7 200 dindes (350 étaient malades dont 50 étaient mortes).

Le cinquième foyer a été identifié le 20 janvier 2021 à Wittmund dans l'arrondissement du même nom dans un élevage de 25 150 canards dont 12 étaient morts.

Les diagnostics virologiques ont été confirmés par PCR par le Friedrich-Loeffler-Institut (Laboratoire national).

2. France

L'ensemble du territoire national métropolitain est classé en niveau de risque «élevé » au regard de l'influenza aviaire depuis le 17 novembre 2020. Depuis le dernier bilan publié le 16 janvier 2021 (nouvelle 16914), 196 nouveaux foyers de GAHP à virus A(H5N8) ont été signalés à l'OIE (signalements OIE 37550 et 37683) les 15 et 22 janvier 2021.

Ces foyers ont été identifiés entre le 26 décembre 2020 et le 18 janvier 2021 dans 168 élevages de canards, 16 élevages de poulets, 11 élevages comportant plusieurs espèces de volailles dont des palmipèdes et un élevage de volaille d'espèce non précisée. Les élevages concernés étaient situés essentiellement dans les départements des Landes (129 foyers), des Pyrénées Atlantiques (24 foyers), du Gers (22 foyers), des Hautes-Pyrénées (1 foyer) et de la Haute-Garonne (1 foyer). L'ensemble de ces foyers a concerné 912 274 oiseaux dont 25 686 étaient morts les survivants ayant été euthanasiés.  

Le diagnostic virologique a été fait par séquençage par l'Anses (Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail) au Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort, site de Ploufragan (Laboratoire national).

Un point de situation a été fait le 22 janvier 2021 par le Ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.

3. Inde

En Inde, après avoir signalé un épisode de GAHP à virus A(H5N8) dans la province du Kerala (voir nouvelle 16914), le Ministry of Fisheries, Animal Husbandry and Dairying a notifié le 18 janvier 2021 à l'OIE (signalement OIE 37637) un deuxième épisode de GAHP à virus A(H5N8) dans la ville de Raipur Rani située dans le district de Panchkula de l'État de l'Haryana. Cet épisode comprend deux foyers identifiés le 2 janvier 2021 :

  • Un foyer dans une exploitation avicole (Siddharth Poultry Farm) de 150 128 volailles, où 16 840 ont été touchées, dont 12127 sont mortes, dans le village de Kheri ;
  • Un foyer dans un élevage (Nature Poultry Farm) de 18 693 volailles où 5 680 ont été infectées, dont 3 876 mortes, dans le village de Dandlawar,

Le 16 janvier 2021, les autorités sanitaires ont signalé à l'OIE deux nouveaux épisodes de GAHP constitués chacun d'un foyer unique (signalements OIE 37639 et 37642) impliquant dans les deux cas un virus A(H5N1).

  • Le 6 janvier 2021, un foyer de GAHP à virus A(H5N1) a été découvert dans la province du Madhya Pradesh. Il concernait un élevage de 1 053 volailles dont 127 étaient mortes situé dans le village de Rundipada, commune de Thandla, district de Jhabua.
  • Le 7 janvier 2021 un foyer de GAHP à virus A(H5N1) a été identifié dans une élevage de 4 286 volailles (843 étaient mortes) situé à Murumba, commune de Parbhani , district de Parbhani, province de Maharashtra.

Dans ces deux cas, les animaux survivants ont été euthanasiés. Le diagnostic virologique a été fait par RRT-PCR par le National Institute of High Security Animal Disease (Laboratoire de référence de l'OIE).

4. Irak

En Irak, les autorités sanitaires ont signalé à l'OIE le 20 janvier 2021 (signalement OIE 37736) un foyer de GAHP à virus A(H5N8) identifié le 12 janvier 2021 dans un élevage de 68 800 volailles dont 63 700 étaient mortes. Cet élevage était situé à Samaraa dans la province de Salah Al-Deen.

Les animaux survivants ont été euthanasiés. Le diagnostic virologique a été confirmé par RT- PCR par le Central Veterinary Laboratory (Laboratoire national).

5. Koweït

Au Koweit, la Public Authority of Agriculture Affairs and Fish Resources a notifié le 21 janvier 2021 à l'OIE  (signalement OIE 37728) un foyer de GAHP à virus A(H5N8) dans une basse-cour de 112 volailles (faisans et oies) à Sulaibiyah, dans le gouvernerait d'Al Jahrah. Depuis le 4 novembre 2020, 24 oiseaux avait présenté des signes cliniques dont 8 sont morts.

Le diagnostic virologique initial a été fait le 8 novembre par RT-PCR par le Central Veterinary and Research Laboratory (Laboratoire national) et les oiseaux survivants ont été abattus dès le diagnostic fait. Le résultat virologiques a été confirmé le 15 janvier 2021 par le Animal and Plant Health Agency, à Weybridge (Royaume Uni) (Laboratoire de référence de l'OIE). Le signalement à l'OIE a été fait à l'issue de cette confirmation.

6. Pologne

En Pologne deux épisodes de GAHP à virus A(H5N8) sont encore actifs.

L'épisode de GAHP à virus A(H5N8) qui avait débuté le 23 novembre (nouvelles 16717,  16804, 16882 et ) en voïvodie de Grande Pologne se poursuit avec le signalement à l'OIE le 19 janvier d'un nouveau foyer (signalements OIE 37707) identifié le 15 janvier dans un élevage de 13 558 dindes (toutes étaient malades dont 10 étaient mortes). Cet élevage était situé dans le village de Czernikow, comté de Mysliborz, en voïvodie de Poméranie occidentale.

L'épisode de GAHP à virus A(H5N8) qui avait débuté le 1 décembre 2020 (voir nouvelle 16772, 16882 et ) se poursuit avec le signalement à l'OIE le 19 janvier de 2 nouveaux foyers (signalements OIE 37708) mis en évidence en voïvodie de Couïavie-Poméranie :

  • Un foyer a été identifié le 12 janvier 2021 dans un élevage de 30 796 dindes (2 999 étaient malades dont 370 étaient mortes) situé dans le village de Kaczkowo, gmina de Gniewkowo
  • Un foyer a été identifié le 16 janvier 2021 dans un élevage de 34 109 poules pondeuses (6 672 étaient malades dont 174 étaient mortes) situé dans le village de Dulsk, powiat d'Inowroclaw.

Dans tous les cas les survivants ont été euthanasiés. Les diagnostics virologiques ont été confirmés par RRT-PCR par le National Veterinary Research Institute (Laboratoire national).

7. République de Corée

En République de Corée, l'épisode de GAHP à virus A(H5N8) qui a débuté le 26 novembre se poursuit (voir les nouvelles 16772 , 16804, 16882 et 16914).

Le 19 janvier 2021, les autorités sanitaires coréennes ont signalé à l'OIE (signalement 37693) la survenue de 15 foyers supplémentaires :

Province de Jeolla du Sud, 4 foyers ont été identifiés dans le cadre de la surveillance mise en place dans le pays, dans des élevages de canards

  • Deux foyers ont été identifiés dans la ville de Gimje
    • Le 15 janvier 2021, dans un élevage de 23 000 canards Gongdeok-myeon du village de Hoeryong-ri
    • Le 16 janvier 2021, dans un élevage de 3 100 canards Mangyeong-eup du village de Daedong-ri
  • Un foyer a été identifié dans le district de Muan le 7 janvier dans un élevage de 11 000 canards
  • Un foyer a été identifié dans le district de Boseong le 15 janvier dans un élevage de 9 000 canards

Province de Gyeonggi, 4 foyers identifiés dans des élevages de poules pondeuses

  • Le 11 janvier 2021 à Namyangju dans un élevage de 38 400 poules (165 mortes) du village de Chasan-ri (muncipalité de Hwado-eup)
  • Le 12 janvier 2021 à Anseong dans un élevage de 390 000 poules (65 mortes) du village de Samheung-ri (municipalité de Geumgwang-myeon)
  • Le 12 janvier 2021 à Pocheon dans un élevage de 180 000 poules (62 mortes) Seondan-dong
  • Le 13 janvier 2021 à Anseong dans un élevage de280 000 poules (125 mortes) du village de Sinchon-ri (muncipalté de Seoun-myeon)

Province de Gyeongsang du Sud, 2 foyers identifiés dans des élevages de canards :

  • Le 11 janvier 2021, un foyer a été identifié dans le cadre de la surveillance dans un élevage de 10 500 canards situé à Samrak-ri , municipalité de Maam-myeon , district de Goseong
  • Le 14 janvier 2021,  un foyer a été identifié dans un élevage de 15 900 canards (30 étaient morts) du village de Munam-ri, municipalité de Okjong-myeon, district de Hadong

Province de Gyeongsang du Nord : un foyer a été identifié le 11 janvier dans un élevage de 38 000 poules pondeuses  (140 étaient mortes) du village de  Sahyeon-ri, municipalité de Nongam-myeon, ville de Mungyeong.

Province de Jeolla du Nord : un foyer a été identifié le 12 janvier 2021 dans le cadre de la surveillance, dans un élevage de 8 600 canards du village de Uil-ri, municipalité de Jeongu-myeon, ville de Jeongeup.

Province du du Chungcheong du Sud :

  • un foyer a été identifié le 12 janvier 2021 dans un élevage de 83 800 poules pondeuses (10 étaient mortes) du village de Doha-ri, municipalité de Seonghwan-eup, district de Seobuk-gu.
  • Un foyer a été identifié le 13 janvier dans un élevage de 41 200 poulets de chair (150 étaient morts) du village de Taebong-ri, municipalité de Guhang-myeon, district de Hongseong-gun

Province du Chungcheong du Nord : un foyer a été identifié le 12 janvier 2021 dans un élevage de 36 000 poules pondeuses (236 étaient mortes) du village de Samho-ri, municipalité de Daeso-myeon, district d'Eumseong-gun.

Les diagnostics virologiques ont été confirmés par RRT-PCR par l'Animal and Plant Quarantine Agency (Laboratoire National). Tous les animaux survivants ont été euthanasiés.

8. Russie

En Russie l'épisode de GAHP à virus A(H5N8) qui a débuté le 18 septembre de poursuit avec le signalement à l'OIE le 18 janvier 2021 (signalement OIE 37630) d'un nouveau foyer ce qui porte le nombre total de foyer dans cet épisode à 6. Ce sixième foyer identifié le 1 janvier 2021 concernait un élevage de 368 724 volailles (25 662 étaient mortes) situé dans le village de Novo Myshastovskaya situé dans le kraï de Krasnodar.

Le diagnostic virologique a combiné culture virale,  RT-PCR et séquençage  et a été fait par le Federal Centre for Animal Health (Laboratoire de référence de l'OIE).

9. Suède

En Suède, deux épisodes sont en cours, le premier implique un virus A(H5N8) et le second un virus A(H5N5).

L'épisode de GAHP à virus A(H5N8) qui avait débuté le 6 novembre 2020 se poursuit avec le signalement à l'OIE le 18 janvier 2021 (signalement OIE 37677) d'un neuvième foyer. Ce foyer identifié le 13 janvier 2021 concernait un élevage de 2 350 dindes (850 étaient malades dont 750 étaient mortes) situé à Skivarp, dans la commune de Skurup, en Scanie. Il s'agit d'une ferme avec des dindes pour la production de viande. La ferme se compose de deux bâtiments. L'un des bâtiments abritait environ 1 500 animaux, sans signes cliniques. L'autre bâtiment abritait environ 850 animaux, qui ont commencé à présenter des signes cliniques de mortalité accrue le 13 janvier.

Le Swedish Board of Agriculture, Ministry of Enterprise and Innovation a notifié le 20 janvier 2021 à l'OIE (signalement OIE 37742), un foyer de GAHP à virus A(H5N5) dans un établissement avicole de 510 000 volailles pour la production d'oeufs où 2 200 ont été retrouvés mortes le 17 janvier 2021 à Fliseryd, municipalité de Mönsterås, dans le comté de Kalmar.

Les volailles survivantes ont été euthanasiées. Le diagnostic virologique a été faut par RT-PCR et séquençage par le National Veterinary Institute (Laboratoire national).

10. Ukraine

En Ukraine, deux épisodes de GAHP sont en cours.

L'épisode de GAHP à virus A(H5N8) qui avait débuté le 23 décembre 2020 se poursuit avec le signalement à l'OIE le 19 janvier 2021 (signalement 37717) d'un troisième foyer identifié le 18 janvier 2021. Ce foyer a été identifié dans une basse-cour de 109 volailles dont 27 étaient mortes situé à Hostomel, oblast de Kiev.

L'épisode de GAHP à virus A(H5) qui a débuté le 2 décembre 2020 se poursuit avec le signalement à l'OIE (signlement OIE 37653) le 16 janvier 2021 d'un foyer identifié le 14 janvier dans une basse-cour de 19 volailles dont 9 étaient mortes situé à Domanivka, dans l'oblast de Nikolayev,

Le diagnostic virologique a été fait par PCR par le State Scientific and Research Institute on Laboratory Diagnosis and Veterinary and Sanitary Expertise (Laboratoire national). Un abattage total a été pratiqué.

11. Viêt Nam

Le 17 janvier 2021, les autorités sanitaires du Viêt Nam ont signalé à l'OIE 5 nouveaux foyers de GAHP à virus A(H5N1) dans le cadre du suivi d'un épisode qui avait débuté le11 février 2020 (signalement OIE 37655).

Ces cinq foyers ont été identifiés entre le 31 août et le 31 décembre 2020 :

  • Le 31 août 2020 dans un élevage de 5 600 volailles (828 étaient malades dont 350 étaient mortes) dans le village de Dai Hai, district de Ke Sach, province de Soc Trang
  • Le 13 septembre 2020 dans un élevage de 604 volailles (150 étaient malades dont 50 étaient mortes) dans le village de Ho Dac Kien, district de Chaun Thanh, province de Soc Trang
  • Le 13 septembre 2020 dans un élevage de 700 volailles (85 étaient malades dont 50 étaient mortes) dans le village de Vinh Hau, district de Hoa Binh, province de Bac Lieu
  • Le 24 septembre 2020 dans un élevage de 300 volailles (45 étaient malades dont 14 étaient mortes) dans le village de Vinh Phu Dong, district de Phuoc Long, Bac Lieu
  • Le 12 octobre 2020 dans un élevage de 100 volailles (330 étaient malades dont 120 étaient mortes) dans le village de Tan Trung, district de Go Cong, province de Tien Giang
  • Le 31 décembre 2020 dans un élevage de 500 volailles (160 étaient malades dont 100 étaient mortes) dans le village de Phuoc Tuy, district de Can Duoc, province de Long An.

Tous les animaux survivants ont été euthanasiés.

Source : Organisation mondiale de la santé animale (OIE).