France : en S06/2024 l'épidémie de grippe se poursuit, l'épidémie de bronchiolite est derrière nous et les indicateurs du covid 19 sont toujours en baisse ou stable à un niveau faible

En France, en semaine 6 de 2024, l'activité des infections respiratoires aigües est en diminution en médecine de ville et globalement stable à l'hôpital.

1. Grippe saisonnière

L'épidémie de grippe se poursuit avec avec une circulation toujours très active des virus grippaux dans l'Hexagone.

Les indicateurs étaient en baisse en médecine de ville et à l’hôpital tous âges confondus avec une tendance variable selon les classes d’âge. Selon les données SOS Médecins, l’activité en médecine de ville était en baisse (24,3% des actes médicaux soit -2,5 points vs S5/2024). A l’hôpital, les indicateurs aux urgences sont stables (la grippe représente 6,6% des passages aux urgences soit -0,4 point vs S5/2024 et 11% des hospitalisations après passage aux urgence soit 0 point).

Dans l'Hexagone, toutes les régions étaient en épidémie.

Les taux de positivité des prélèvements en ville et à l’hôpital sont en augmentation en médecine de ville avec un taux de positivité de 51,4% soit -1,4 points vs S5/2024) et à l'hôpital avec une taux de 16,9% soit -4,3 points vs S5/2024.

Depuis la S40, 481 cas graves de grippe ont été signalés, dont 85% avaient plus de 18 ans et 37% 65 ans ou plus. Pour les 416 cas pour lesquels le virus a été typé, 413 (99%) virus de type A ont été identifiés. Parmi les 286 cas pour lesquels le statut vaccinal était renseigné, 84% n’étaient pas vaccinés contre la grippe. Cinquante six décès ont été signalés, dont 32 (57%) chez les 65 ans ou plus (données non consolidées).

En ville, parmi les 3 280 prélèvements testés depuis la semaine 40, 681 virus grippaux ont été détectés, la très grande majorité étaient de type A : 510 A(H1N1)pdm09, 155 A(H3N2), A31 non sous-typés, 2 B/Victoria et 1 B lignage non déterminé (parmi eux 1 cas de co-infection A(H1N1)pdm09 A(H3N2). A l'hôpital, parmi les 246 692 prélèvements testés depuis la semaine 40, 18 732 se sont avérés positifs pour un virus grippe (7,6%), dont 15 666 virus de type A non sous-typés, 2 117 A(H1N1)pdm09, 688 A(H3N2) et 261 virus de type B.

Les analyses de caractérisations antigénique et génétique réalisées par le CNR des virus respiratoires sur les virus grippaux A(H3N2) et A(H1N1)pdm09 co-circulant ces dernières semaines indiquent que les virus présentent toujours le même profil :

• les virus A(H1N1)pdm09 caractérisés sont antigéniquement et génétiquement apparentés à la souche vaccinale présente dans le vaccin hémisphère sud (HS) 2023 (A/Sydney/5/2021 clade 5a.2a) et proches de la souche vaccinale présente dans le vaccin hémisphère nord 2023-24 (A/Victoria/4897/2022 clade 5a.2a.1). Actuellement les virus A(H1N1)pdm09 sont majoritaires et le profil antigénique des virus permet d’anticiper une bonne efficacité du vaccin.
• les virus A(H3N2) caractérisés présentent un profil antigénique non totalement apparenté à la souche vaccinale présente dans le vaccin hémisphère nord 2023-24 (A/Darwin/9/2021 clade 2a). Ils sont antigéniquement apparentés aux souches du clade 2a.3a.1 présentes dans le vaccin hémisphère sud 2024 (A/Thaïland/8/2022 et A/Massachusetts/18/2022). Le séquençage montre que les virus circulants appartiennent aux clades 2a.3a ou 2a.3a.1, ce dernier clade étant majoritaire parmi les H3N2. Pour les virus A(H3N2), la protection vaccinale pourrait être plus faible.

Dans les DROM, la Guyane, Guadeloupe et la Martinique restaient en épidémie cette semaine.

Les estimations de la couverture vaccinale (CV) grippe au 30/11/2023 chez les personnes à risque ciblées par la vaccination indiquaient une CV à 45,9%, avec 52,7% chez les 65 ans et plus et 24,5% chez les moins de 65 ans à risque de grippe sévère. Ces couvertures vaccinales sont inférieures à celles estimées pour la saison 2022-2023 à la même date.

2. Bronchiolite

En France hexagonale, l'ensemble des régions est hors épidémie de bronchiolite.

Tous les indicateurs étaient à des niveaux bas et en diminution. Chez les moins de 2 ans, la bronchiolite représente respectivement 4,1% ( -0,3 points vs S3/2024), 7,1% ( -0,6 points) et 14,6% ( -2,3 points) des actes de SOS médecins, des passages aux urgences et des hospitalisations après passage aux urgences par rapport à la S5/2024.

Le taux de positivité pour le VRS dans les prélèvements naso-pharyngés tous âges était en diminution en ville (0% soit -1,1 points vs S5/2024) et en milieu hospitalier (1,5% soit -0,4 points).

En semaine 06/2024, dans l’Hexagone seule la Corse est en phase post-épidémique de bronchiolite, les autres régions étant revenues au niveau de base.

Dans les départements et régions d’outre-mer, Mayotte demeurait en épidémie et La Réunion passait cette semaine en phase post-épidémique. La Guadeloupe restait en phase post-épidémique comme en S5/2024. La Martinique et la Guyane étaient revenues à un niveau de base.

3. Covid 19

Concernant le covid, les indicateurs syndromiques étaient en baisse ou stables selon les classes d’âge en ville et à l'hôpital.

Depuis la S40, 598** cas graves de covid** ont été signalés, dont 93% étaient âgés de plus de 18 ans et 63% de 65 ans ou plus. Parmi eux, la majorité étaient des hommes (67%) et la présence de comorbidité était reportée pour 88% des cas. Cent-quatre décès ont été signalés, dont 81 chez les 65 ans et plus (données non consolidées). Sur les 296 cas pour lesquels les informations concernant la vaccination étaient connues, seuls 20 avaient bénéficié d'un rappel datant de moins de 6 mois.

Le taux de positivité des prélèvements étaient en diminution en médecine de ville (2,4% soit -5,5 points vs S5/2024) et à l'hôpital (4,8% soit -1,3%). Le taux de positivité des tests en laboratoires de biologie médicale était de 4,4% (-0,9 points vs S5/2024). Dans les eaux usées, le nombre de positif a chuté de 23,7%.

Concernant la surveillance génomique, Le variant JN.1 est aujourd’hui dominant en France et au niveau mondial. En France hexagonale, JN.1 représentait 82% des séquences interprétables de l’enquête Flash du 22/01/2024 (contre 80% pour celle du 15/01/2024). Les autres variants classés sont détectés dans des proportions faibles.

A l’issue de la semaine 06/2024, la couverture vaccinale covid de la campagne d’automne 2023 pour les personnes âgées de 65 ans n'a pas progressé. Elle est de 30%.

Les couvertures vaccinales chez les professionnels de santé pour la campagne d’automne 2023 à l’issue de la semaine 06 étaient estimées à 9,8% pour ceux exerçant en Ehpad, 11% pour les libéraux et 12,1% pour ceux exerçant en établissement de santé. Pour les résidents en Ehpad, du fait d’un délai de saisie dans l’outil Vaccin Covid des vaccinations contre la Covid-19 réalisées, de nouvelles estimations de couverture vaccinale seront publiées d’ici la fin de la saison.

Source : Santé publique France.