France: l'efficacité de la vaccination antigrippale au cours de la saison 2024-2025 a été inférieure à celle de la saison précédente, en particulier chez les personnes de 65 ans et plus (25% vs 42%) et vis à vis du virus A(H3N2) (29% vs 41%)
Le revue Emerging Microbes and Infections publie une étude qui avait pour objectif d'étudier l'impact de la diversité génétique de la grippe sur l'efficacité vaccinale (EV) au cours de la saison grippale 2024-2025 en France qui a été caractérisée par une durée prolongée et une cocirculation inhabituelle des trois virus (A(H1N1)pdm09, A(H3N2), B/Victoria).
Cette étude a été menée sur une cohorte de patients du réseau RELAB, un réseau de laboratoires privés communautaires comptant 1 600 sites répartis sur tout le territoire national, couvrant une population suffisamment importante pour produire des estimations fiables de l'EV. Elle a inclus 77 704 patients qui ont bénéficié d’un dépistage de la grippe par un test RT-PCR triplex réalisé entre la semaine 44 de 2024 et la semaine 14 de 2025 (du 28/10/2024 au 31/03/2025) et pour lesquels les informations suivantes étaient connues : le sexe, la tranche d'âge, la technique de PCR, la semaine du test, la vaccination entre 15 jours et 6 mois avant le test ou la non-vaccination. Un sous-ensemble aléatoire de 4 612 échantillons positifs à la grippe a été typé, et un sous-ensemble de 2 119 échantillons a été séquencé, permettant d'estimer l'EV pour plusieurs clades et sous-clades, et de comparer la distribution des sous-clades selon le statut vaccinal. La méthode du test négatif (« Test-Negative Design ») a été utilisée pour déterminer l’EV.
RESULTATS
Sur les 77 704 patients inclus, 20 650 (27%) ont été testés positifs pour la grippe en RT-PCR. La grippe A a été détectée sur 65 % d’entre eux et la B sur 35%. La grippe A a prédominé initialement, puis a diminué au cours de la saison, tandis que la grippe B est devenue plus répandue. Les virus A(H1N1)pdm09 représentaient 31% des virus sous-typés, les virus A(H3N2) 32% et les virus de type B, tous de lignage B/Victoria, 37%.
La couverture vaccinale chez les personnes âgées de 65 ans et plus était de 45 % (n = 7 937/17 487).
L'EV globale basée sur les infections confirmées par PCR était de 44 % (IC à 95 % : 41-48 %), l'EV sur les infection à virus A et B était respectivement de 32,1% et 77,6%.
L’EV chez les personnes âgées de 65 ans et plus chutait : l'EV globale était de 25,1% (IC : 18,2-31,5) , et l'EV sur les infections à virus A et B était respectivement de 22,8 % (IC : 13-31,6) et 57% (IC : 34,5-71,8).
L’EV variait en fonction des sous-types de virus et des sous-clades.
- La population de virus A(H1N1)pdm09 séquencée était composée de 91% (n = 1263/1388) de virus de clade 5a.2a et de 9% (n = 125/1388) de virus de clade 5a.2a.1, le sous-clade dominant étant 5a.2a.1(C.1.9.3) (n = 958/1 388 ; 69 %). Le sous-clade 5a.2a.1(D.3) est apparu vers la semaine 50 et a connu une forte augmentation pour devenir le plus répandu. L’EV globale parmi les individus vaccinés 15 jours à 3 mois avant le test (15j-3 mois) était de 40,5% (IC : 17,2-57,3) vis-à-vis du sous-type A(H1N1)pdm09, de 41,4% vis-à-vis du clade 5a.2a, et de 46,8% vis-à-vis du sous-clade 5a.2a.1(C.1.9.3). L'émergence du sous-clade 5a.2a.1 (D.3) était significativement plus fréquente chez les personnes vaccinées que chez les personnes non vaccinées (6 % vs 2 %).
- La population de virus A(H3N2) était composée essentiellement du clade 2a.3a.1, le sous-clade 2a.3a.1(J.2) étant le plus répandu (n = 1 197/1 426 ; 84 %). L'EV globale de la catégorie 15j-3m était de 29,5% (IC : 5,2-48,7) vis-à-vis du sous-type A(H3N2), et de 31,1% (IC : 4,5-50,3) à vis du sous-clade 2a.3a.1(J.2). En raison de la faible EV, le sous-clade J.2 des virus A(H3N2) était significativement plus fréquent chez les individus vaccinés (46 %) que chez les non vaccinés (25 %).
- La population de virus B/Victoria était constituée d'un seul clade (V1A.3a.2). L’EV globale sur le virus B/Victoria était de 80,5% (IC : 69,6-87,4). Aucune différence significative n'a été observée concernant l'EV contre l'infection par les sous-clades de B/Victoria.
POINTS DE LA DISCUSSION
Les résultats rapportés concordent avec les estimations intermédiaires européennes, qui reflètent une combinaison de vaccins inactivés, de vaccins à forte dose et de vaccins avec adjuvant. Par contre, ils diffèrent des estimations intermédiaires canadiennes qui ont montré une efficacité supérieure, en particulier chez les personnes âgées de 65 ans et plus, ce qui pourrait refléter l'administration de vaccins à forte dose ou avec adjuvant, dont l'efficacité a été démontrée.
Si couverture vaccinale dans les 15 jours à 6 mois a augmenté de 3 % (de 42 % à 45 %) par rapport à la saison 2023-2024, ce taux reste insuffisant pour atteindre l'objectif de 75 % fixé par l'Organisation mondiale de la Santé.
L'efficacité vaccinale globale pour l'intervalle de vaccination de 15 jours à 6 mois a chuté de 48 % à 45 % entre les saisons 2023-2024 et 2024-2025, en particulier chez les personnes de 65 ans et plus (de 42 % à 25 %). L'EV sur la grippe A a diminué de 15 points (de 47 % à 32 %), dont une réduction de 12 points pour la grippe A(H3N2) (de 41 % à 29 %) alors que l'efficacité pour la grippe A(H1N1)pdm09 était inchangée (41% à 40%). La composition du vaccin A(H1N1)pdm09 est restée inchangée entre les deux saisons et la caractérisation antigénique des virus A(H1N1)pdm09 a montré qu'ils restaient antigéniquement similaires à la souche vaccinale. La composition du vaccin A(H3N2) a par contré évoluée, mais la souche vaccinale montrait une incompatibilité partielle avec le souches circulant en 2024-2025.
Le sous-clade émergent A(H1N1)pdm09 5a.2a.1 (D.3) était nettement plus fréquent chez les personnes vaccinées que chez les personnes non vaccinées, mais la taille limitée de l'échantillon n'a pas permis de calculer l'EV vis à vis de ce sous-clade. Aucune différence de substitutions sur l'hémagglutinine n'a été observée dans les infections à D.3 entre les personnes vaccinées et non vaccinées. Des investigations complémentaires sont nécessaires pour déterminer si cela reflète une réelle différence de fitness, d'évasion immunitaire ou un facteur de confusion. La sous-clade D.3 est devenue le variant dominant de la grippe A(H1N1)pdm09 dans le monde en avril 2025 et est actuellement la plus répandue en Australie au début de la saison grippale.
Pour le sous-clade J.2 de la grippe A(H3N2), le sous-clade A(H3N2) le plus répandu durant la saison 2024-2025 et associé à une EV estimée plus faible, la mutation HA1:N122D a été observée dans tous les cas (vaccinés et non vaccinés). Cette substitution pourrait avoir contribué à la réduction de l'efficacité vaccinale.
LES AUTEURS CONCLUENT que la faible couverture vaccinale, combinée à une efficacité particulièrement faible contre la grippe A(H3N2) et le type A chez les personnes âgées, pourrait avoir contribué à la forte activité grippale au cours de la saison 2024-2025. L'émergence de la grippe A(H1N1)pdm09 5a.2a.1 (D.3) suscite des incertitudes et nécessite une surveillance. L'introduction prochaine du vaccin antigrippal à forte dose (EFLUELDA) et avec adjuvant (FLUAD) en France cette saison (2025-2026) pourrait améliorer l'efficacité vaccinale et nécessitera une évaluation génomique plus poussée pour évaluer son impact sur les variants circulants.